甘肃省农科院作物所成立于2007年，是在我院粮食作物研究所的基础上，整合原经济作物研究所育种力量成立，主要从事玉米、油料、小杂粮、豆类、棉花等作物新品种选育、繁殖及推广；科技扶贫开发、农作物品种资源收集、保存及研究等科研工作。单位编制72人现，有在职职工58人，其中研究员8人，副研究员14人（含高级农艺师）。有博士研究生导师1、硕士研究生导师3人，博士4人，硕士13人，在读博士6人。有1人入选国家“百千万”人才工程，4人入选甘肃省“555”人才工程，1人入选甘肃省“333”人才工程，1人享受政府特殊津贴。“十一五”期间，我所共获得甘肃省科技进步一等奖2项，二等奖2项，三等奖5项。兰州市科技进步三等奖1项。其中，胡麻新品种陇亚9号、陇亚10号分别获得2006年、2010年甘肃省科技进步一等奖。共选育出农作物新品种15个，育成了国际首例胡麻杂交新品种陇亚杂1号、陇亚杂2号.

甘肃省农科院作物所拥有一支基础知识扎实、业务实践能力较强的科研队伍,共设有各类作物育种室组七个。

玉米育种室：从事玉米新杂交种选育的专业研究机构，主要开展普通玉米新杂交种选育、特用玉米新杂交种选育、国内外玉米新杂交种引进筛选等工作。

杂粮育种室：主要开展糜、谷、燕麦等杂粮的新品种的引进、选育及推广工作。

油料作物育种室：主要开展亚麻、油菜、油葵等油料作物的新品种引进、选育及推广。

豆类育种室：主要开展豌豆、大豆等豆类作物的新品种引进、选育及推广。

棉花育种室：主要开展棉花新品种的引进、选育及推广。

农作物种质资源研究保存室：从事主要农作物种质资源研究工作已有近30年历史， 1993年建成了甘肃省唯一的农作物种质资源库（国家中期库），总建筑面积800m2,库内设有一间可容纳12000余份种质的低温库，配有清选、干燥、发芽、熏蒸、风干等专用间，同时配备了熏蒸箱、清选机、光照培养箱、种子干燥烘箱等仪器设备，建有67m3的低温库一间。征集鉴定、编目入库了39个品资类型的10837份种质资源，获得种质信息20多万条。完成了粮食、油料、瓜菜、绿肥牧草等45种作物的种质表型数据库建设工作，数据库服务器于2007年9月挂接到甘肃省农科院门户网站，且接入甘肃省科技平台，向全社会公开发布种质信息，用户在互联网上可进行数值直接查询和模糊查询，首次实现了我省农作物种质资源信息的网络化社会共享。

作物遗传育种实验室：拥有近红外品质分析仪、人工气候培养箱等育种工作辅助仪器。

目前在研项目35项，其中国家现代农业产业技术体系首席科学家1人，岗位科学家3人，综合试验站1个。国家自然基金项目6项，国家油料作物改良中心胡麻分中心，农业部野外观测台站2个，国家科技支撑计划1项，各类省级科技项目18项。